Основой отбора базовых клонов является тщательная визуальная оценка каждого растения в период бутонизации - цветения с дополнительной проверкой каждого из них по листовым пробам методом иммуно-ферментного анализа .
Предварительно намечают к отбору растения, отвечающие следующим основным требованиям:
- типичность и хорошая выраженность основных сортоотличительных признаков растения, стебля, листа, соцветия;
- абсолютно здоровый вид растений по внешним признакам - доли листа равномерно окрашены, без признаков крапчатости, складчатости, скручивания или закручивания, гладкие или с характерной для сорта волнистостью;
- нормальное развитие растений с характерным для сорта количеством основных стеблей (все стебли в кусте по толщине и высоте равномерно развиты).
При уборке урожай каждого растения выкапывают вручную, выкладывают в лунку и каждое гнездо индивидуально оценивают по сортовой типичности и здоровью с учетом следующих основных требований:
- типичность формы клубней для данного сорта, отсутствие признаков веретеновидности;
- отсутствие симптомов болезней в соответствии с допусками, установленными действующими государственными стандартами на оздоровленный исходный материал;
- характерное (типичное) для сорта количество стандартных по размеру клубней и переход от крупных к мелким, типичный для основной массы здоровых растений.
Урожай каждого отобранного растения (клона) помещают в отдельный пакет или в сетчатый мешочек и закладывают на зимнее хранение на стеллажах в хранилищах при наиболее благоприятных режимах температуры и влажности воздуха. Для проведения послеуборочного или зимнего «глазкового» лабораторного теста с применением иммуно-ферментного анализа от каждого клона берут один-два клубня.
На следующий год проводят оценку отобранных базовых клонов по потомству. Те растения, на которых обнаруживают даже слабые симптомы проявления вирусных, бактериальных болезней или вироида веретеновидности клубней, выбраковывают из банка здоровых сортов картофеля. Клоны, свободные от фитопатогенов, используют для введения в культуру и получения новых исходных линий для коллекции in vitro.